ردیابی اختصاصی phytopthora inundata از طریق واکنش زنجیره ای پلیمراز ساده و تودرتو
نویسندگان
چکیده
گونة phytophthora inundataبه تازگی توصیف شده و به علت خصوصیات ریختشناختی و حداکثر دمای رشد غیرعادی، شناسایی آن دشوار است. این گونه با سایر گونههای بیمارگر گیاهی جنس phytophthoraکه بدون پاپیل و گرماپسند هستند، اشتباه میشود. در این بررسی برای شناسایی p. inundataشیوهای براساس واکنش زنجیرهای پلیمراز ساده و تودرتو ابداع شد. بدین منظور مجموعهای از جدایهها مربوط به میزبانهای مختلف که نمایندة تنوع موجود در توالی نواحی رمزگذار و فاقد رمز این گونه بودند، مورد بررسی قرار گرفت. براساس توالیهای جداکنندة نسخهبرداری شدة داخلی یک و دو و ژن 8/5 اس مربوط به دیاِناِی ریبوزومی (آیتیاِس)، ژن پروتئین مقاوم به شوک حرارتی 90، ژنهای پروتئین پیوستة تریوزفسفات ایزومراز/گلیسرآلدئید سه فسفات دی هیدروژناز و هم چنین ژن پروتئین 60 اس ریبوزومی ال 10، برای گونة مذکور ده عدد آغازگرِ واکنش زنجیرهای پلیمراز اختصاصی طراحی گردید. برای ایجاد بیشترین اختصاصیت و کارآیی، دمای جفتشدگی و زمان گسترش برای هر جفت آغازگر بهینهسازی گردید. برای ارزیابی آغازگرها از 28 گونة دیگر فیتوفتورا که از نظر ریختشناختی و مولکولی تأیید شده بودند، استفاده شد. در اغلب موارد هیچیک از مجموعه آغازگرها قادر به فزونسازی دیاِناِی خالصسازی شده از گونههای phytophthora غیرخودی نبودند. واکاویها نشان داد که بهترین نامزد برای شناسایی جدایههای p. inundata مجموعة its-i1 میباشد که از ترکیب آغازگرهای its-if1 و its-if2 تشکیل شده است. دمای جفتشدگی بهینه برای این مجموعه 69 درجة سانتیگراد و بهترین زمان گسترش 40 ثانیه میباشد. به نظر میرسد استفاده از واکنش زنجیرهای تودرتو با استفاده از مجموعة its-i1 به همراه آغازگرهای عمومی its4 و its6 به عنوان آغازگرهای خارجی حداقل 50 برابر حساستر از روش سنتی است.
منابع مشابه
ردیابی اختصاصی Phytopthora inundata از طریق واکنش زنجیرهای پلیمراز ساده و تودرتو
گونة Phytophthora inundataبه تازگی توصیف شده و به علت خصوصیات ریختشناختی و حداکثر دمای رشد غیرعادی، شناسایی آن دشوار است. این گونه با سایر گونههای بیمارگر گیاهی جنس Phytophthoraکه بدون پاپیل و گرماپسند هستند، اشتباه میشود. در این بررسی برای شناسایی P. inundataشیوهای براساس واکنش زنجیرهای پلیمراز ساده و تودرتو ابداع شد. بدین منظور مجموعهای از جدایهها مربوط به م...
متن کاملشناسایی و ردیابی اختصاصی phytopthora drechsleri، p. cryptogea و p. erythroseptica با واکنش زنجیره ای پلیمراز
گونه های phytophthora drechsleri، p. cryptogea و p. erythroseptica بیمارگرهای گیاهی اُاُمیستی خویشاوندند و از نظر ریخت شناختی به یک دیگر شباهت دارند. برای تمایز این آرایه ها از یک دیگر و از سایر گونه هایی که صفات ریخت شناختی همگرا دارند، شیوه ای بر اساس واکنش زنجیره ای پلیمراز ساده و تودرتو ابداع شد. بدین منظور مجموعه ای از جدایه ها مربوط به میزبان های مختلف، که نماینده ی تنوع موجود در ژن های هست...
متن کاملشناسایی و ردیابی اختصاصی Phytopthora drechsleri، P. cryptogea و P. erythroseptica با واکنش زنجیرهای پلیمراز
گونههای Phytophthora drechsleri، P. cryptogea و P. erythroseptica بیمارگرهای گیاهی اُاُمیستی خویشاوندند و از نظر ریختشناختی به یک‌دیگر شباهت دارند. برای تمایز این آرایه‌ها از یک‌دیگر و از سایر گونه‌هایی که صفات ریختشناختی همگرا دارند، شیوهای بر اساس واکنش زنجیرهای پلیمراز ساده و تودرتو ابداع شد. بدین منظور مجموعهای از جدایهها مربوط به میزبانهای مختلف، که نماینده...
متن کاملتشخیص و ردیابی مایکوپلاسما سینوویه از مرغداری های صنعتی بااستفاده از روش واکنش زنجیره ای پلیمراز بر اساس ژنvlhA
مایکوپلاسما سینوویه مهمترین عامل بیماریزا در ماکیان است و همه سالهخسارات اقتصادی قابل توجهی را متوجه صنعت طیور در ایران می سازد. مایکوپلاسما سینوویه قادر به بیان لیپوپروتئین هماگلوتینین متغیرvlhA Variable lipoprotein hemagglutinin A می باشد که نقش مهمی در ایجاد بیماری ایفا می کند. هدف اصلی این مطالعه تشخیص و شناسایی جدایه های مایکوپلاسما سینوویه بر اساس ژنvlhA بود. از گله های طیور صنعتی سه اس...
متن کاملآغازگرهای اختصاصی مبتنی بر واکنش زنجیره ای پلیمراز برای ردیابی picoa lefebvrei در ریشه های carex stenophylla
گونه های picoa، آرایه های آسکومیست زیرزمینی می باشند که در نواحی نیمه خشک شمال آفریقا، غرب آسیا، جنوب اروپا و کشورهای خاورمیانه از جمله ایران یافت می شود. گونه های این جنس با ریشه گیاهان علفی یک ساله و چند ساله از جنس helianthemum شامل:h. ledifolium،h. salicifolium var. salicifolium ، h. nummularium و h. squamatum تشکیل قارچ-ریشه می دهند. در ایران، رابطه قارچ-ریشه بین دنبل های بیابانی و گیاهان ...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
عنوان ژورنال:
بیماریهای گیاهیناشر: انجمن بیماری شناسی گیاهی ایران
ISSN 2774-0006
دوره 48
شماره 1 2012
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023